Цейский ледник расположен на северном склоне Большого Кавказа, в пределах Бокового хребта.
Он берет начало на фирновых полях горного массива Адай-Хох, на высоте свыше 4,000 метров над уровнем моря, и движется до рекордно низкой для Кавказа отметки — около 2,200 метров.
Благодаря такому перепаду высот Цейский ледник считается одним из самых низко спускающихся ледников региона.
Это один из крупнейших долинных ледников Кавказа и один из наиболее значительных в России.
Его длина составляет около 8,6 километра, а площадь — примерно 9,7 квадратного километра.
Цейский ледник заканчивается в одноименном ущелье, которое издавна славится своим мягким целебным климатом.
Еще в XIX веке сюда приезжали для лечения больные туберкулёзом, а в 1909 году северо-осетинский просветитель Бабу Зангиев (1869–1937) построил здесь первый дом отдыха, положив начало развитию курорта.
Не менее богата и природа Цейского ущелья.
В его лесах обитают дагестанский тур, серна, лисица и бурый медведь.
Редкие виды животных, включая зубра и рысь, находятся под государственной охраной.
Кроме того, на территории заповедника отмечено около 200 видов птиц, 18 из которых занесены в Красную книгу.