Храм Святого Ипатия находится на территории крепости Абаата в Гагре.
Предположительно, он был построен в VI–VII веках — в период, когда Византия активно укрепляла свои черноморские границы.
Как и большинство раннехристианских памятников региона, эта трехнефная базилика сложена из грубо отесанных блоков известняка.
Единственное украшение скромного фасада — болнисский крест, вытесанный над входом.
Храм освящен в честь священномученика Ипатия Гагрского: по преданиям, он проповедовал христианство в окрестностях города и был похоронен под стенами базилики.
В XVI веке, на фоне религиозного давления и набегов Османской империи на Черноморское побережье, храм опустел и простоял в заброшенном виде почти три столетия.
После высадки русского десанта в 1830 году историческое здание приспособили под пороховой склад.
Во время Крымской войны (1853–1856 годы), из-за угрозы со стороны британского флота, укрепления Абаата были взорваны и оставлены гарнизоном.
Затем чудом уцелевший храм ждали новые испытания.
Когда после войны укрепления начали восстанавливать, на территории крепости разместили военный госпиталь, а церковь вновь превратили в склад.
Лишь в 1902 году по инициативе принцессы Евгении Максимилиановны Романовской (супруги принца Ольденбургского) в здании восстановили свод и возобновили богослужения.