თბილისის რკინიგზის სადგური პირველად 1872 წელს, ქალაქ ზესტაფონსა და თბილისს შორის რკინიგზის ფოთი-თბილისის მონაკვეთის დასრულების შემდეგ გაიხსნა. პირველი მატარებელი აქ ფოთიდან 1872 წლის 10 ოქტომბერს ჩამოვიდა. იმ დროს სადგურს ორი სამგზავრო ტერმინალი ჰქონდა – ცენტრალური და ბორჯომის. სამწუხაროდ, ამ საფოსტო ბარათზე გამოსახული შენობა საბჭოთა ხელისუფლებამ 1952 წელს დაანგრია და მის ნაცვლად სტალინური არქიტექტურის სახლის ტიპიური ნიმუში დაიდო. მაგრამ ეს სადგურიც 1982 წელს დაიშალა, რის შემდეგაც იგი ბრუტალისტურ სტილში აღადგინეს. სტალინური სტრუქტურის საძირკველი იმდენად ძლიერი იყო, რომ მისი დემონტაჟის დროს მისი აფეთქება გახდა საჭირო. ამჟამინდელი რკინიგზის სადგურის შენობის მშენებლობა დემონტაჟისთანავე დაიწყო, მაგრამ არ დასრულებულა საბჭოთა კავშირის დაშლამდე. 2008 წელს თბილისის საქალაქო ხელისუფლებამ დაასრულა სადგურის გაფორმება და რკინიგზის ბაქნების მოდერნიზება, 2010 წელს კი სადგურზე სავაჭრო ცენტრი გაიხსნა.