არქეოლოგიური მტკიცებულებები აჩვენებს, რომ ქუთაისი კოლხეთის სამეფოს დედაქალაქი იყო ჯერ კიდევ ძვ.წ. VI-V საუკუნეებში.
ანტიკური ავტორები ამ ქალაქს არგონავტების მითს უკავშირებენ.
მოგვიანებით, ის ლაზიკის რეგიონის ცენტრი გახდა, VIII საუკუნეში არაბებმა დაანგრიეს, შემდეგ კი აფხაზეთის სამეფომ აღადგინა.
808 წელს მეფე ლეონმა ის თავის რეზიდენციად აქცია, ხოლო XI საუკუნეში ქუთაისი ერთიანი ქართული სახელმწიფოს ნაწილი გახდა.
XVII-XVIII საუკუნეებში ქალაქი არაერთხელ შეიცვალა: იმერელმა მთავრებმა ციხესიმაგრე თურქებს დაუთმეს, სანამ სოლომონ I-მა, რუსეთის მხარდაჭერით, 1770 წელს არ გაათავისუფლა იგი.
აქ გეორგიევსკის ტრაქტატის შესახებ მოლაპარაკებები გაიმართა.
XIX საუკუნის დასაწყისში, ელაზნაურის კონვენციისა და მეფე სოლომონ II-ის გადაყენების შემდეგ, ქუთაისი საბოლოოდ გახდა იმერეთის რეგიონის ცენტრი.